Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF10P55107 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF10P55107 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF10P55107 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF10P55107 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF10P55107 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF10P55107 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF10P55107 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF10P55107 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF10P55107 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF10P55107 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF10P55107 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF10P55107 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF10P55107 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms