Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHBP55084 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHBP55084 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHBP55084 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HADHBP55084 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HADHBP55084 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HADHBP55084 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHBP55084 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHBP55084 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHBP55084 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHBP55084 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHBP55084 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHBP55084 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHBP55084 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHBP55084 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHBP55084 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHBP55084 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms