Protein–RNA interactions for Protein: P54578

USP14, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP14P54578 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP14P54578 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP14P54578 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP14P54578 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP14P54578 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP14P54578 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP14P54578 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP14P54578 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP14P54578 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP14P54578 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP14P54578 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP14P54578 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP14P54578 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP14P54578 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP14P54578 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP14P54578 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP14P54578 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP14P54578 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP14P54578 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP14P54578 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP14P54578 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP14P54578 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP14P54578 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP14P54578 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP14P54578 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP14P54578 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP14P54578 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP14P54578 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP14P54578 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP14P54578 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP14P54578 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP14P54578 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP14P54578 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP14P54578 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms