Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNS1AP54105 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms