Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms