Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOSBP53539 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOSBP53539 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOSBP53539 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOSBP53539 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOSBP53539 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOSBP53539 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOSBP53539 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOSBP53539 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOSBP53539 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOSBP53539 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOSBP53539 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOSBP53539 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FOSBP53539 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOSBP53539 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOSBP53539 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOSBP53539 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOSBP53539 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOSBP53539 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOSBP53539 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FOSBP53539 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOSBP53539 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FOSBP53539 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOSBP53539 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOSBP53539 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FOSBP53539 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms