Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFIP2P53365 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARFIP2P53365 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFIP2P53365 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms