Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKX2-5P52952 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms