Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN6P51797 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN6P51797 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms