Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB27AP51159 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms