Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1A2P50993 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms