Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUMBP49757 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUMBP49757 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUMBP49757 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUMBP49757 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUMBP49757 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUMBP49757 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUMBP49757 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUMBP49757 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUMBP49757 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUMBP49757 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUMBP49757 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUMBP49757 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUMBP49757 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUMBP49757 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUMBP49757 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUMBP49757 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUMBP49757 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUMBP49757 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUMBP49757 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUMBP49757 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUMBP49757 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUMBP49757 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms