Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIP4K2AP48426 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms