Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPTX2P47972 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms