Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPL28P46779 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL28P46779 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL28P46779 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL28P46779 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL28P46779 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL28P46779 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RPL28P46779 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RPL28P46779 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RPL28P46779 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL28P46779 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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