Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSKP43235 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSKP43235 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSKP43235 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSKP43235 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSKP43235 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSKP43235 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSKP43235 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CTSKP43235 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSKP43235 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSKP43235 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSKP43235 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSKP43235 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms