Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL35P42766 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL35P42766 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL35P42766 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL35P42766 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL35P42766 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL35P42766 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL35P42766 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL35P42766 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL35P42766 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL35P42766 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms