Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ELK3P41970 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELK3P41970 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELK3P41970 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELK3P41970 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELK3P41970 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELK3P41970 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELK3P41970 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELK3P41970 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELK3P41970 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ELK3P41970 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELK3P41970 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELK3P41970 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELK3P41970 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELK3P41970 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ELK3P41970 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELK3P41970 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELK3P41970 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELK3P41970 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELK3P41970 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms