Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms