Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH1P40925 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH1P40925 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH1P40925 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH1P40925 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH1P40925 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH1P40925 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH1P40925 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH1P40925 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH1P40925 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH1P40925 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH1P40925 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH1P40925 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH1P40925 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MDH1P40925 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MDH1P40925 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MDH1P40925 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH1P40925 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH1P40925 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH1P40925 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms