Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCK1P35558 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCK1P35558 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCK1P35558 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCK1P35558 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK1P35558 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK1P35558 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK1P35558 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK1P35558 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK1P35558 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK1P35558 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCK1P35558 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCK1P35558 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK1P35558 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK1P35558 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK1P35558 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK1P35558 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK1P35558 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK1P35558 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCK1P35558 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCK1P35558 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCK1P35558 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCK1P35558 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCK1P35558 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCK1P35558 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCK1P35558 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCK1P35558 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms