Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms