Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BMI1P35226 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMI1P35226 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMI1P35226 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMI1P35226 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMI1P35226 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMI1P35226 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMI1P35226 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMI1P35226 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMI1P35226 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BMI1P35226 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BMI1P35226 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BMI1P35226 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms