Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2H1P32780 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms