Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASQ1P31415 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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