Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP1P29466 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP1P29466 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP1P29466 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP1P29466 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP1P29466 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP1P29466 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP1P29466 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP1P29466 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP1P29466 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP1P29466 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP1P29466 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP1P29466 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP1P29466 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP1P29466 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP1P29466 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP1P29466 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP1P29466 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP1P29466 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP1P29466 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP1P29466 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP1P29466 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP1P29466 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP1P29466 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP1P29466 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP1P29466 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP1P29466 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP1P29466 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP1P29466 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP1P29466 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP1P29466 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP1P29466 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP1P29466 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP1P29466 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP1P29466 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP1P29466 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP1P29466 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP1P29466 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP1P29466 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP1P29466 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP1P29466 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms