Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB2P29323 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms