Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB3P28472 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms