Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSSP25774 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSSP25774 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSSP25774 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSSP25774 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSSP25774 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTSSP25774 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTSSP25774 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTSSP25774 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTSSP25774 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTSSP25774 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSSP25774 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms