Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGFR4P22455 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms