Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT1P21579 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT1P21579 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT1P21579 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT1P21579 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT1P21579 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT1P21579 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT1P21579 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT1P21579 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT1P21579 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT1P21579 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT1P21579 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT1P21579 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT1P21579 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT1P21579 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT1P21579 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT1P21579 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT1P21579 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT1P21579 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms