Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDCP19113 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDCP19113 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDCP19113 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDCP19113 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDCP19113 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDCP19113 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDCP19113 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDCP19113 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDCP19113 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDCP19113 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDCP19113 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDCP19113 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDCP19113 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDCP19113 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDCP19113 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDCP19113 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDCP19113 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDCP19113 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDCP19113 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDCP19113 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDCP19113 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDCP19113 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDCP19113 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDCP19113 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDCP19113 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDCP19113 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDCP19113 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDCP19113 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDCP19113 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms