Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPI1P17947 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPI1P17947 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPI1P17947 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPI1P17947 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPI1P17947 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPI1P17947 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPI1P17947 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPI1P17947 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPI1P17947 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SPI1P17947 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms