Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF7P17544 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF7P17544 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF7P17544 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF7P17544 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF7P17544 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7P17544 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7P17544 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7P17544 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7P17544 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF7P17544 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF7P17544 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF7P17544 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF7P17544 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF7P17544 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF7P17544 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF7P17544 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF7P17544 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF7P17544 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms