Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA1P17302 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA1P17302 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA1P17302 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA1P17302 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA1P17302 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA1P17302 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA1P17302 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA1P17302 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA1P17302 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA1P17302 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA1P17302 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA1P17302 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA1P17302 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA1P17302 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA1P17302 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA1P17302 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA1P17302 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA1P17302 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA1P17302 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA1P17302 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA1P17302 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA1P17302 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA1P17302 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA1P17302 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms