Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GSPT1P15170 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSPT1P15170 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms