Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDPSP14324 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDPSP14324 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FDPSP14324 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FDPSP14324 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FDPSP14324 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FDPSP14324 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FDPSP14324 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FDPSP14324 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FDPSP14324 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDPSP14324 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDPSP14324 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDPSP14324 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDPSP14324 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FDPSP14324 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FDPSP14324 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDPSP14324 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDPSP14324 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDPSP14324 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDPSP14324 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDPSP14324 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FDPSP14324 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FDPSP14324 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FDPSP14324 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FDPSP14324 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FDPSP14324 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FDPSP14324 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FDPSP14324 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FDPSP14324 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FDPSP14324 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FDPSP14324 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FDPSP14324 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FDPSP14324 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FDPSP14324 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FDPSP14324 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FDPSP14324 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FDPSP14324 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FDPSP14324 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDPSP14324 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDPSP14324 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDPSP14324 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDPSP14324 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FDPSP14324 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms