Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCANP13611 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCANP13611 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCANP13611 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCANP13611 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCANP13611 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCANP13611 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCANP13611 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCANP13611 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCANP13611 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCANP13611 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCANP13611 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCANP13611 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCANP13611 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCANP13611 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCANP13611 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCANP13611 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCANP13611 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCANP13611 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCANP13611 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
VCANP13611 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms