Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA4P12838 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms