Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MS4A1P11836 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MS4A1P11836 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms