Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRFP11831 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRFP11831 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRFP11831 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRFP11831 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRFP11831 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRFP11831 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRFP11831 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRFP11831 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms