Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALAP11233 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALAP11233 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALAP11233 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALAP11233 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALAP11233 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALAP11233 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALAP11233 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALAP11233 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RALAP11233 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALAP11233 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALAP11233 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALAP11233 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALAP11233 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALAP11233 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RALAP11233 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALAP11233 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms