Protein–RNA interactions for Protein: P11217

PYGM, Glycogen phosphorylase, muscle form, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGMP11217 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGMP11217 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGMP11217 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGMP11217 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYGMP11217 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYGMP11217 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYGMP11217 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYGMP11217 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGMP11217 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGMP11217 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGMP11217 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGMP11217 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYGMP11217 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYGMP11217 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGMP11217 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGMP11217 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGMP11217 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYGMP11217 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYGMP11217 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYGMP11217 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYGMP11217 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PYGMP11217 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYGMP11217 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYGMP11217 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYGMP11217 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGMP11217 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGMP11217 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGMP11217 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGMP11217 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYGMP11217 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms