Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAMP11215 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAMP11215 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAMP11215 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAMP11215 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAMP11215 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAMP11215 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAMP11215 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAMP11215 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAMP11215 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAMP11215 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms