Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP10827 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP10827 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP10827 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP10827 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP10827 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP10827 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP10827 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP10827 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP10827 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP10827 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP10827 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP10827 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP10827 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP10827 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP10827 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP10827 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP10827 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP10827 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP10827 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP10827 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP10827 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP10827 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRAP10827 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRAP10827 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRAP10827 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRAP10827 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRAP10827 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRAP10827 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRAP10827 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRAP10827 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRAP10827 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRAP10827 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRAP10827 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRAP10827 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP10827 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
THRAP10827 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms