Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP3P10745 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP3P10745 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP3P10745 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP3P10745 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP3P10745 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP3P10745 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP3P10745 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP3P10745 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP3P10745 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP3P10745 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP3P10745 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP3P10745 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP3P10745 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP3P10745 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP3P10745 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP3P10745 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP3P10745 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP3P10745 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP3P10745 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP3P10745 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP3P10745 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP3P10745 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP3P10745 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP3P10745 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP3P10745 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP3P10745 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP3P10745 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms