Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALM1P0DP23 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALM1P0DP23 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM1P0DP23 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms