Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM200BP0CF97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms