Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms