Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CENPBP07199 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CENPBP07199 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CENPBP07199 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CENPBP07199 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CENPBP07199 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CENPBP07199 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CENPBP07199 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CENPBP07199 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CENPBP07199 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CENPBP07199 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CENPBP07199 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CENPBP07199 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CENPBP07199 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CENPBP07199 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CENPBP07199 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CENPBP07199 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CENPBP07199 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CENPBP07199 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CENPBP07199 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CENPBP07199 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CENPBP07199 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CENPBP07199 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CENPBP07199 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CENPBP07199 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CENPBP07199 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CENPBP07199 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CENPBP07199 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CENPBP07199 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CENPBP07199 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CENPBP07199 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CENPBP07199 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CENPBP07199 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CENPBP07199 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CENPBP07199 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPBP07199 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPBP07199 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPBP07199 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPBP07199 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPBP07199 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CENPBP07199 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CENPBP07199 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CENPBP07199 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CENPBP07199 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CENPBP07199 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CENPBP07199 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CENPBP07199 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CENPBP07199 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CENPBP07199 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CENPBP07199 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CENPBP07199 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CENPBP07199 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CENPBP07199 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CENPBP07199 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms